Pondok Pesantren Wahdah Islamiyah mulai di rintis pada 1 Maret 2008 terdorong oleh hadirnya Raudhatul Athfal (RA) Qurrotu A'yun Wahdah Islamiyah Gorontalo yang akan menamatkan alumni pertamanya disamping sekian banyak anak usia sekolah ibtidaiyah di sekitar lokasi Pondok Pesantren yang harus berjalan kaki dengan jarak yang cukup jauh untuk mendapatkan pelayanan pendidikan di Sekolah Dasar (SD), dan dorongan dari beberapa orang tua santri yang sudah mengenal kiprah Wahdah Islamiyah di lapangan dakwah Islamiyah di Propinsi Gorontalo khususnya.
Sehingga Dewan Pimpinan Cabang Wahdah Islamiyah melalui departemen pendidikan dan latihan berinisiatif mendirikan sebuah yayasan pendidikan yang akan mengelola lembaga pendidikan.
Selanjutnya Yayasan mencari para dermawan sebagai donatur Pondok Pesantren. Alhamdulillah dengan izin Allah Ta’la yayasan mendapatkan donatur dari Saudi Arabia yang bersedia memberikan dana awal untuk pembangunan masjid dan satu unit gedung yang dipergunakan sebagai ruang kegiatan belajar.
Sehingga Dewan Pimpinan Cabang Wahdah Islamiyah melalui departemen pendidikan dan latihan berinisiatif mendirikan sebuah yayasan pendidikan yang akan mengelola lembaga pendidikan.
Selanjutnya Yayasan mencari para dermawan sebagai donatur Pondok Pesantren. Alhamdulillah dengan izin Allah Ta’la yayasan mendapatkan donatur dari Saudi Arabia yang bersedia memberikan dana awal untuk pembangunan masjid dan satu unit gedung yang dipergunakan sebagai ruang kegiatan belajar.